Website được thiết kế tối ưu cho thành viên chính thức. Hãy Đăng nhập hoặc Đăng ký để truy cập đầy đủ nội dung và chức năng. Nội dung bạn cần không thấy trên website, có thể do bạn chưa đăng nhập. Nếu là thành viên của website, bạn cũng có thể yêu cầu trong nhóm Zalo "NCKH Members" các nội dung bạn quan tâm.

Đánh giá hoạt tính ức chế enzyme ACE2 (thụ thể chủ) và protein 6LU7 (SARS-CoV-2) của một số thuốc tiềm năng bằng tính toán hóa lượng tử và mô phỏng docking phân tử

nckh
Thông tin nghiên cứu
Loại tài liệu
Bài báo trên tạp chí khoa học (Journal Article)
Tiêu đề
Đánh giá hoạt tính ức chế enzyme ACE2 (thụ thể chủ) và protein 6LU7 (SARS-CoV-2) của một số thuốc tiềm năng bằng tính toán hóa lượng tử và mô phỏng docking phân tử
Tác giả
Bùi Quang Thành; Phan Tứ Quý; Nguyễn Vĩnh Phú; Nguyễn Hồ Vũ Phong; Nguyễn Thị Thanh Hải; Nguyễn Thị Ái Nhung
Năm xuất bản
2022
Số tạp chí
02
Trang bắt đầu
35-51
ISSN
2354-0850
Tóm tắt

Một số thuốc chloroquine (D1), favipiravir (D2), hydroxychloroquine (D3), penciclovir (D4) có hoạt tính kháng nhiều loại virus và có tiềm năng ức chế SARS-CoV. Các thông số hóa học lượng tử được khảo sát bằng phương pháp lý thuyết phiếm hàm mật độ (DFT). Khả năng ức chế protein ACE2 của thụ thể chủ và protein 6LU7 của SARS-CoV-2 được đánh giá bằng phương pháp mô phỏng docking phân tử, khả năng tương thích sinh học được khẳng định thông qua các thông số hóa lý từ hệ thống QSARIS và quy tắc Lipinski 5. Kết quả tính toán hóa lượng tử cho thấy các thuốc này thích hợp cho quá trình tương tác giữa các phân tử với cấu trúc protein. Mô phỏng docking phân tử chỉ ra protein ACE2 bị ức chế mạnh bởi các thuốc khảo sát và hiệu quả ức chế theo thứ tự D2 > D3 > D1 > D4, trong khi khả năng ức chế của các thuốc với protein 6LU7 theo thứ tự D1 > D3 > D2 > D4. Thuốc D3 được dự đoán là có hiệu quả ức chế nhất đối với 2 protein (DStrung bình= -14,2 kcal.mol-1) và có khả năng tương thích sinh học (Khối lượng phân tử: 336,8 amu; LogP: 3.89; Độ phân cực: 38,7 Å3). Về mặt lý thuyết, tất cả các thuốc đều có tiềm năng trong việc điều trị SARS-CoV-2 và được khuyến khích thêm các thử nghiệm lâm sàng liên quan.

Abstract

The drugs, chloroquine (D1), favipiravir (D2), hydroxychloroquine (D3), penciclovir (D4), are well-known performing broad-spectrum activity against a variety of viruses with high potentiality for the treatment of SARS-CoV-2 disease. Quantum properties were examined using density functional theory (DFT). The inhibitability of the drugs towards enzyme ACE2 and SARS-CoV-2 main protease (6LU7) was evaluated by molecular docking simulation, while their bio-compatibility was justified by physicochemical properties obtained from QSARIS-based analysis in reference to Lipinski's rule of five. Quantum analysis suggests that the drugs are highly favourable for intermolecular interaction towards protein structures. Docking results indicate that protein ACE2 is strongly inhibited by drugs investigated and the inhibitory effectiveness is in the order D2 > D3 > D1 > D4 while the overall inhibitability of the drugs with protein 6LU7 follows the order D1 > D3 > D2 > D4. D3 is predicted as the most effective inhibitor towards both targeted protein structures (DSaverage -14.2 kcal.mol-1 ) and the most bio-compatible molecule (Mass 336.8 amu; LogP 3.89; Polarisability 38.7 Å3 ). The theoretical investigation suggests all drugs promising for treatment of SARS-CoV-2 infection and encourages inrelated clinical trials.