Hiệu quả chẩn đoán trên lâm sàng của các phương pháp xét nghiệm PCR chẩn đoán SARS-CoV-2 đóng vai trò rất quan trọng trong công tác xác định ca bệnh, theo dõi điều trị cũng như dự báo quy mô diễn biến dịch. Chúng tôi thực hiện nghiên cứu này nhằm đánh giá sự đồng nhất về kết quả xét nghiệm Realtime RTPCR thực hiện trên hệ thống COBAS 6800 so với quy trình được Tổ chức Y tế Thế giới (WHO) khuyến cáo trên 309 mẫu bệnh phẩm dịch tỵ hầu của người bệnh trong thời gian từ 2020 đến 2022 tại Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới Trung ương. Kết quả cho thấy, hệ thống COBAS 6800 phát hiện được nhiều mẫu dương tính hơn so với khi làm theo quy trình WHO, trong đó số mẫu cho kết quả dương tính khi thực hiện quy trình WHO là 232/309 (chiếm 75%), và trên Cobas 6800 là 281/309 (91%). Hệ số Kappa phản ánh mức độ tương đồng giữa hai phương pháp xét nghiệm bằng 0,43 tương ứng với mức độ phù hợp trung bình. Mức độ chênh lệch trung bình giữa giá trị Ct của gen E theo quy trình WHO so với giá trị Ct của gene ORF và gen E trên COBAS 6800 lần lượt là 3,18 và 2,38 cho thấy khả năng phát hiện vi rút theo hệ thống COBAS 6800 cao hơn gấp 10 lần. Do vậy, khi cần đáp ứng khẩn cấp dịch bệnh do SARS-CoV-2 gây ra, phòng xét nghiệm nên đưa vào sử dụng hệ thống xét nghiệm tự động có độ nhạy tốt hơn để có thể sàng lọc số lượng mẫu lớn.
The clinical diagnostic efficiency of SARS-CoV-2 PCR methods plays a vital role in case detection, treatment and epidemic prevention. We conducted this study to evaluate the concordance of Realtime RT-PCR test results performed on Cobas 6800 system comparing with the procedure recommended by the World Health Organization (WHO) on 309 nasopharyngeal swab samples collected at the National Hospital for Tropical Diseases from 2020 to 2022. The results showed that the Cobas 6800 system detected more positive samples than those tested by the WHO protocol, in which the number of positive samples tested by the WHO and Cobas 6800 protocol were 232/309 (75%) 281/309 (91%), respectively. The Kappa coefficient reflects the similarity between the two test methods was 0.43, corresponding to the average degree of concordance. The average difference between the Ct value of the E gene according to the WHO protocol compared with the Ct value of the ORF gene and the E gene on Cobas 6800 is 3.18 and 2.38, respectively, indicating a 10-time higher of virus-detecting capacity when using COBAS 6800 system compared to WHO protocol. Thus, the automated COBAS 6800 system should be used in urgent situations such as a novel epidemic for screening large numbers of samples as well as avoiding false negative results.
- Đăng nhập để gửi ý kiến