Website được thiết kế tối ưu cho thành viên chính thức. Hãy Đăng nhập hoặc Đăng ký để truy cập đầy đủ nội dung và chức năng. Nội dung bạn cần không thấy trên website, có thể do bạn chưa đăng nhập. Nếu là thành viên của website, bạn cũng có thể yêu cầu trong nhóm Zalo "NCKH Members" các nội dung bạn quan tâm.

Nghiên cứu xây dựng phương pháp phát hiện nhanh vi khuẩn Salmonella spp. trên nền mẫu thịt bằng phương pháp loop mediated isothermal amplification (LAMP)

nckh
Thông tin nghiên cứu
Loại tài liệu
Bài báo trên tạp chí khoa học (Journal Article)
Tiêu đề
Nghiên cứu xây dựng phương pháp phát hiện nhanh vi khuẩn Salmonella spp. trên nền mẫu thịt bằng phương pháp loop mediated isothermal amplification (LAMP)
Tác giả
Nguyễn Phạm Trúc Phương; Đoàn Thị Quỳnh Hương
Năm xuất bản
2020
Số tạp chí
8
Trang bắt đầu
472-478
ISSN
1859-2171
Tóm tắt

Salmonella là một trong những vi khuẩn gây ra ngộ độc thực phẩm và phân lập ở hầu hết thực phẩm. Mục tiêu của nghiên cứu này là thiết lập được quy trình phát hiện nhanh vi khuẩn Salmonella spp. trên nền mẫu thịt bằng phương pháp Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) đặc hiệu với gen invA, đáp ứng yêu cầu ứng dụng phân tích. Kết quả nghiên cứu đã xây dựng được quy trình phân tích trực tiếp Salmonella từ mẫu thịt dựa trên phản ứng LAMP, bao gồm (1) tăng sinh mẫu (25 g) trong môi trường (150 ml dung dịch đệm pepton 75 ml canh thang RVS), trong thời gian 10 giờ trên nền mẫu thịt tươi; cải tiến phương pháp tách chiết nhanh thu DNA từ dịch tăng sinh mẫu thực phẩm đó là sử dụng đệm NaOH 100 mM, gia nhiệt 5 phút tại 95°C, siêu âm 30 giây, ly tâm 10.000 vòng/phút trong 2 phút thu dịch DNA cho phản ứng LAMP. Kết quả nghiên cứu cho thấy phương pháp được xây dựng có độ đặc hiệu (SP) đạt 94%; độ chính xác (AC) đạt 94%; độ nhạy (SE) đạt 100%; tỷ lệ âm tính giả 0% và tỷ lệ dương tính giả 6%, LOD50 là 3 CFU/25g. Hiệu quả phân tích Salmonella bằng phương pháp LAMP được được xây dựng tương đương với phương pháp nuôi cấy theo TCVN 10780-12017 (ISO 6579-12017) trên nền mẫu thịt nhưng có kết quả cho thời gian phân tích ngắn khoảng 10 giờ.

Abstract

Salmonella is the main pathogens that contaminate animal products and cause human Salmonella food poisoning. The objective of this study establish a rapid detection process for Salmonella spp. in meat samples by Loop Mediated Isothermal Amplification (LAMP) method specific to invA gene, meeting the requirements of analytical applications. The results of the study have built direct analysis processes of Salmonella from food based on the Loop Mediated Isothermal Amplification reaction, including (1) Take meat sample (25 gram) are enriched in 150 ml Buffer Pepton Water (BPW) 75 ml Rappaport Vassiliadis Soya Broth (RVS) in a period of 10 hours, prior to DNA extraction for LAMP; (2) To improve the method of rapid DNA extraction from food enrichment fluid that using 100 mM NaOH buffer (meat), 5 minutes heating at 95°C, 30 seconds ultrasound, 10.000 rpm/g centrifugation in 2 minutes of collection DNA for LAMP reaction. The results of evaluating of method show that the LAMP method have sensitivity (SE) is 100%, accuracy is (AC) 94%, specificity (SP) is 94%, the false positive rate is 6% and false negative rate is 0%. The above results indicate the LAMP has been set up and the standard method according to TCVN 10780-12017 (ISO 6579-12017) are equivalent for detection of Salmonella in meat, but the time for analysising of LAMP is shorter, only 10 hours.