Website được thiết kế tối ưu cho thành viên chính thức. Hãy Đăng nhập hoặc Đăng ký để truy cập đầy đủ nội dung và chức năng. Nội dung bạn cần không thấy trên website, có thể do bạn chưa đăng nhập. Nếu là thành viên của website, bạn cũng có thể yêu cầu trong nhóm Zalo "NCKH Members" các nội dung bạn quan tâm.

Quan hệ di truyền các loài Coronavirus dựa trên vùng protein không cấu trúc (NSP11) gene ORF1ab

nckh
Thông tin nghiên cứu
Loại tài liệu
Bài báo trên tạp chí khoa học (Journal Article)
Tiêu đề
Quan hệ di truyền các loài Coronavirus dựa trên vùng protein không cấu trúc (NSP11) gene ORF1ab
Tác giả
Trương Thế Quang
Năm xuất bản
2021
Số tạp chí
27
Trang bắt đầu
62-68
ISSN
2525-2429
Tóm tắt

Giải thành công bài toán sắp hàng nhiều trình tự NSP11 các loài coronavirus (CoV) thuộc chi Betacoronavirus. Phân chi Embercovirus có khoảng cách di truyền xa đối với các phân chi Sarbecovirus, Nobecovirus, Merbecovirus và Hibecovirus với khoảng cách di truyền lần lượt là 1,097; 1,125; 1,113 và 1,141. Phân chi Sarbecovirus có khoảng cách di truyền gần với các phân chi Nobecovirus, Merbecovirus và Hibecovirus với khoảng cách di truyền lần lượt là 0,584; 0,563 và 0,461. Trong phân chi Sarbecovirus SARS-CoV-2 người có quan hệ di truyền gần gũi với CoV tê tê với tỷ lệ tương đồng 99,19 % và CoV dơi với tỷ lệ tương đồng 96,64 %. CoV tê tê và CoV dơi có mối quan hệ di truyền chặt chẽ với tỷ lệ tương đồng là 96,70 %. Có thể chứng minh giả thuyết SARS-CoV-2 người có nguồn gốc lây truyền từ CoV dơi hoặc tê tê.

Abstract

We successfully solved the problem of multiple NSP11 sequences alignment of coronavirus (CoV) species of genus Betacoronavirus. Subgenus Embercovirus has a long genetic distance for subgenus Sarbecovirus, Nobecovirus, Merbecovirus and Hibecovirus with a genetic distance of 1.097, 1.125, 1.113 and 1.141 respectively. Subgenus Sarbecovirus has a close genetic distance for subgenus Nobecovirus, Merbecovirus and Hibecovirus with a genetic distance of 0.584, 0.563 and 0.461 respectively. In the subgenus Sarbecovirus, human-SARS-CoV-2 had a close genetic relationship for pangolin CoV with a identity of 99.19% and bat CoV with a identity of 96.64%. Both pangolin CoV and bat CoV have a close genetic relationship with a identity of 96.70%. It is possible to prove hypothesis SARS-CoV-2 is from bat CoV or pangolin CoV.