Định danh cây dược liệu bằng mã vạch DNA ngày càng phổ biến do tính chính xác cao. Để định danh được bằng mã vạch DNA, các nhà nghiên cứu thường sử dụng các phần mềm máy tính giúp phân tích, so sánh trình tự DNA của mẫu nghiên cứu với các trình tự có sẵn trên Genbank. Do dữ liệu trình tự gen được công bố tăng nhanh về số lượng nên để tiến hành phân tích hiệu quả các dữ liệu này, các phần mềm cần phải dễ sử dụng, có khả năng tính toán nhanh, chính xác và cung cấp nhiều phương pháp thống kê khác nhau. Trong nhóm các phần mềm này thì ba phần mềm BLAST trong NCBI, BioEdit v7.0.5.2, MEGA 7 được sử dụng phổ biến nhất do đáp ứng được các yêu cầu trên. Bài báo giới thiệu ba phần mềm để định danh cây dược liệu với ví dụ minh họa là định danh mẫu Thổ nhân sâm (Talinum paniculatum) bằng mã vạch vùng ITS. Kết quả nghiên cứu của bài báo cho thấy quy trình phối hợp ba phần mềm để định danh cây dược liệu bằng DNA cho kết quả chính xác nhất.
The identification of medicinal plants with DNA barcodes is increasingly popular due to its high accuracy. To identify using DNA barcodes, researchers often use computer software to analyze and compare DNA barcodes of research samples with barcodes available on Genbank. Because the published gene sequence data increases rapidly in number, in order to conduct an effective analysis of these data, the software needs to be easy to use, able to calculate quickly, accurately and provide many statistical methods. In this group of software, three software programs, including BLAST software in NCBI, BioEdit v7.0.5.2, MEGA 7, are most commonly used due to meeting the above requirements. The article introduces three software programs to identify medicinal plants with illustrative examples of identifying the Jewels of Opar (Talinum paniculatum) pattern by ITS region barcodes. The research results of the paper show that the process of combining three software programs to identify medicinal plants by DNA gives the most accurate results.
- Đăng nhập để gửi ý kiến