Lichen phẳng miệng (LPM) là một trong những bệnh lý niêm mạc miệng phổ biến nhất, nhưng vẫn chưa có cách chữa. Nghiên cứu này nhằm hiểu rõ hơn về dấu ấn gen trong sinh bệnh học LPM thông qua phân tích các bộ dữ liệu phiên mã có sẵn trong cơ sở dữ liệu công cộng. Hai tập dữ liệu phiên mã được tải xuống và phân tích theo hai hướng: toàn bộ hoặc một phần dữ liệu sau khi loại bỏ các ngoại lai. Các gen biểu hiện khác biệt (DEG) tăng điều hoà trong bộ dữ liệu biểu mô LPM so với người khỏe mạnh về phát triển biểu bì, biệt hóa tế bào sừng, sừng hóa, phản ứng với nhiễm khuẩn và phản ứng miễn dịch bẩm sinh. Ngược lại, DEG tăng điều hoà trong bộ dữ liệu của toàn bộ lớp niêm mạc LPM chủ yếu phản ánh hoá ứng động của tế bào miễn dịch và phản ứng viêm/miễn dịch. 43 DEG trùng lặp trong hai tập dữ liệu được xác định sau khi loại bỏ các ngoại lai khỏi mỗi tập dữ liệu. Các DEG chung liên quan đến tăng sừng, lành thương, khiếm khuyết hàng rào biểu mô và phản ứng với nhiễm khuẩn. Tóm lại, chúng tôi xác định được các dấu ấn gen liên quan đến sự tăng sừng, lành thương, khiếm khuyết hàng rào biểu mô và phản ứng với nhiễm trùng trong LPM.
Oral lichen planus (OLP) is one of the most common oral mucosal diseases, but there is still no cure. This study aimed to investigate the gene signatures of OLP through analysis of transcriptomic datasets available in public databases. Two transcriptomic datasets were downloaded and analyzed in two ways: the entire set or subset of data after removing outliers. Differentially expressed genes (DEGs) upregulated in OLP epithelial dataset compared to healthy individuals involved in keratinocyte differentiation, keratinization, epidermal development, response to infection, and innate immune response. In contrast, the upregulated DEGs in the dataset of the OLP mucosa mainly reflected immune cell chemotaxis and inflammatory/immune responses. 43 overlapping DEGs in the two datasets were identified after removing outliers from each dataset. Common DEGs were involved in hyperkeratosis, wound healing, barrier defects, and response to infection. In summary, we identified gene signatures associated with hyperkeratosis, wound healing, epithelial barrier defects, and response to infection in OLP.
- Đăng nhập để gửi ý kiến