Acid kojic là một tác nhân được sử dụng phổ biến trong mỹ phẩm làm trắng da. Acid kojic là một chất chuyển hóa thứ cấp có trong một số loài nấm thuộc chi Aspergillus. Nghiên cứu gần đây đã xác định kojA là một gen đóng vai trò quan trọng trong con đường sinh tổng hợp acid kojic ở Aspergillus oryzae. Mục đích: Dự đoán độ tan của protein KojA nhằm thiết kế plasmid mang gen tái tổ hợp phù hợp có khả năng tạo protein dạng tan trong Escherichia coli. Phương pháp: Xây dựng mô hình tương đồng mô phỏng cấu trúc của KojA bằng SWISS-MODEL. Tiếp theo sử dụng ba công cụ Protein-Sol, SOLart và SoDoPE để dự đoán khả năng tan in silico của KojA, bao gồm khả năng tan khi dung hợp với các tag. Kết quả: Cả ba công cụ đều cho kết quả dự đoán KojA kém tan. Theo SoDoPE độ tan có thể cải thiện khi gắn thêm các tag như MBP, SUMO. Kết luận: Nghiên cứu đã dự đoán khả năng hoà tan của KojA và đề xuất thiết kế gen tái tổ hợp ở dạng dung hợp với tag SUMO với gen kojA được tối ưu hoá codon để biểu hiện trên E. coli.
Kojic acid is a skin-whittening agent widely used in cosmetics. It is a secondary metabolite produced by a few Aspergillus species. Recent studies have identified that gene kojA played an important role in the biosynthetic pathway of kojic acid in Aspergillus oryzae. Objectives: This study aims to predict the solubility of protein KojA, and design the recombinant plasmid thereof to express KojA as soluble protein in Escherichia coli. Methods: A homology model of KojA was built using SWISS-MODEL server. Three tools including Protein-Sol, SOLart và SoDoPE were applied to predict the solubility of KojA and its fusion with tags. Results: All three tools predicted a poor solubility of KojA; the solubility can be improved with tags MBP and SUMO as suggested by SoDoPE. Conclusions: The study has predicted the solubility of protein KojA and proposed a recombinant plasmid in which kojA is fused with SUMO and condons optimized for expression in E. coli.
- Đăng nhập để gửi ý kiến