Website được thiết kế tối ưu cho thành viên chính thức. Hãy Đăng nhập hoặc Đăng ký để truy cập đầy đủ nội dung và chức năng. Nội dung bạn cần không thấy trên website, có thể do bạn chưa đăng nhập. Nếu là thành viên của website, bạn cũng có thể yêu cầu trong nhóm Zalo "NCKH Members" các nội dung bạn quan tâm.

Các dòng đột biến của severe acute respiratory syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) dựa trên ORF8

nckh
Thông tin nghiên cứu
Loại tài liệu
Bài báo trên tạp chí khoa học (Journal Article)
Tiêu đề
Các dòng đột biến của severe acute respiratory syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) dựa trên ORF8
Tác giả
Trương Thế Quang
Năm xuất bản
2021
Số tạp chí
28
Trang bắt đầu
81-87
ISSN
2525-2429
Tóm tắt

Mười sáu trình tự protein ORF8 của SARS-CoV-2 và một trình tự ORF8 tham chiếu YP_009724396.1 Vũ Hán, Trung Quốc được thu thập từ cơ sở dữ liệu GenBank, Mỹ. Kết quả sắp hàng hai trình tự ORF8 của SARS-CoV-2 với trình tự ORF8 tham chiếu YP_009724396.1 nhận diện được bốn dòng đột biến. Trong đó, có 15 đột biến ưa nước làm tăng độc lực và khả năng lây nhiễm của virus có xác suất xuất hiện cao nhất 48,40%, 6 đột biến kỵ nước bảo toàn tính kỵ nước của ORF8 có xác suất xuất hiện 19,35%, 4 đột biến trung tính ưa nước không làm thay đổi chức năng của ORF8 có xác suất xuất hiện 12,90% và 6 đột biến trung tính kỵ nước không làm thay đổi chức năng của ORF8 có xác suất xuất hiện 19,35%. Chứng tỏ ORF8 là một loại protein tiến hóa cao.

Abstract

Sixteen ORF8 protein sequences of SARS-CoV-2 and a reference ORF8 sequence YP_009724396.1 in Wuhan, China were collected from USA GenBank database. The results of pairwise sequence alignment of each SARS-CoV-2 ORF8 sequence and reference ORF8 sequence YP_009724396.1 identified four mutant flows. Of which, there are 15 hydrophilic mutations that increase the virulence and infectivity of the virus with the highest appearing probability 48.40%, 6 hydrophobic mutations that preserve the hydrophobicity of ORF8 have the appearing probability 19.35%, 4 hydrophibic neutral mutations that do not change the functions of ORF8 have appearing probability 12.90% and 6 hydrophilic neutral mutations that do not change the functions of ORF8 have appearing probability 19.35%. Demonstrates ORF8 is a highly evolved protein.