Phân tích một số đặc điểm phân tử của các chủng vi khuẩn Escherichia coli mang gen mcr-1 đã phân lập được từ mẫu phân của người khỏe mạnh tại Thái Bình trong giai đoạn 2013 - 2016. Đối tượng nghiên cứu bao gồm 31 chủng vi khuẩn Escherichia coli đã được xác định là mang gen mcr-1 và có kiểu hình kháng colistin (nồng độ ức chế tối thiểu với colistin MIC ≥ 4 mg/L). Kiểu gen mã hóa ESBL, gen kháng colistin mcr-1, sự có mặt của transposon ISApl1 và các plasmid của các chủng E. coli mang gen mcr-1 đều được xác định bằng kỹ thuật PCR. Liên quan di truyền giữa các chủng E. coli mang gen mcr-1 được phân tích bằng kỹ thuật điện di xung trường (PFGE). Kết quả cho thấy hầu hết (96,8%) các chủng E. coli mang gen mcr-1 cũng đồng thời mang gen mã hóa ESBL, trong đó hai kiểu gen chiếm tỷ lệ cao nhất là CTX-M-9 (48,4%) và CTX-M-9/TEM (25,8%). Mỗi chủng E. coli mang gen mcr-1 có thể có từ 1 - 6 loại plasmid khác nhau trong số 14 loại plasmid được phát hiện ở các chủng này. Ba loại plasmid thường gặp nhất là plasmid HI2 (54,8%), FIB (48,4%) và N (41,9%). Trình tự ISApl1 được phát hiện ở 83,9% số chủng E. coli mang gen mcr-1. Kết quả phân tích PFGE cho thấy có 4 chủng tạo thành hai nhóm di truyền mà các chủng trong cùng nhóm có tỷ lệ tương đồng di truyền là 100%. Nghiên cứu cho thấy có sự lây lan của vi khuẩn E. coli mang gen mcr-1 đồng thời mang gen sinh ESBL trong quần thể người khỏe mạnh tại Thái Bình. Sự đa dạng của các loại plasmid và tỷ lệ cao mang trình tự ISApl1 ở vi khuẩn E. coli có thể là các yếu tố thuận lợi cho sự lan truyền gen mcr-1 ở vi khuẩn E. coli trên người khỏe mạnh tại Thái Bình.
To analyse several molecular characteristics of Escherichia coli harboring mcr-1 isolated from stool samples of healthy residents in Thai Binh during the period 2013 - 2016. The subject consisted of 31 Escherichia coli strains previously determined to carry the mcr-1 gene and have a colistin-resistant phenotype (MIC ≥ 4 mg/L). The presence of ESBL coding genes, mcr-1 gene, ISAp11 sequence and plasmid replicon types in E. coli were all determined by PCR methods. The genetic relationship among E. coli harboring mcr-1 isolates was assessed by PFGE assay. The result indicated that most of E. coli harboring mcr-1 strains (96.8%) also harbored ESBL-coding gene(s), of which the two genotypes accounted for the highest rates were CTX-M-9 (48.4%) and CTX-M-9/TEM (25.8%). Each of E. coli harboring mcr-1 strains was capable of carrying from 1 to 6 different types of 14 plasmid replicon types detected in these strains. Three most common plasmid replicon types were HI2 (54.8%), FIB (48.4%) and N (41.9%). The ISApl1 sequence was detected in 83.9% of these isolates. Result of PFGE analysis showed that there were 4 strains forming two genetic groups where two strains in each group had a genetic similarity rate of 100%. The study showed that E. coli harboring mcr-1 and ESBL-coding genes was widely spread among healthy residents in Thai Binh. The diversity of plasmid replicon types and the high rate of ISApl1 sequence detected in E. coli may facilitate the transmission of the mcr-1 gene among E. coli bacteria in healthy residents in Thai Binh.
- Đăng nhập để gửi ý kiến