Sử dụng hai bộ dữ liệu microarray với một nền tảng được tiêu chuẩn hóa để điều tra sự biểu hiện microRNA (miRNA) toàn diện từ 1.100 mẫu huyết thanh. Một mô hình chẩn đoán miRNA được phát triển từ kết quả giải trình tự cao thông lượng các mẫu huyết thanh bệnh nhân UTG, kết quả qRT-PCR từ các nghiên cứu trên PubMed và các mẫu huyết thanh ung thư khác (Ung thư dạ dày, Ung thư đường mật, Bệnh tuyến tụy/đường mật lành tính, Ung thư ruột kết, Ung thư thực quản, Ung thư tuyến tụy) đáp ứng các tiêu chí phân tích, với đối chứng là mẫu huyết thanh người bình thường. Phần mềm R v.4.1.1 và gói phân tích dữ liệu Limma đã được sử dụng để tiến hành dự đoán sự thay đổi biểu hiện miRNA. Cuối cùng, phân tích diện tích dưới đường cong (AUC) đã được thực hiện để đánh giá tiềm năng chẩn đoán của các dấu ấn sinh học miRNA này. 17 miRNA biểu hiện tăng như hsa-miR-141-3p, hsa-miR-1228-5p, hsa-miR-625, hsa-miR-1249, hsa-miR-1913, hsa-miR-3675, hsa -miR-4731, hsa-miR-4783, hsa-miR-6510, hsa-miR-6515, hsa-miR-6766, hsa-miR-6795, hsa-miR-6796, hsa-miR-6798, hsa-miR -6800, hsa-miR-6859, hsa-miR-6870 và 4 miRNA biểu hiện giảm như hsa-miR-199a-5p, hsa-miR-192-5p, hsa-miR-323a, hsa-miR-4706 khi so sánh giữa huyết thanh bệnh nhân UTG và nhóm chứng khỏe mạnh. Những phát hiện của nghiên cứu này cho thấy rằng các miRNA huyết thanh có tiềm năng để phát triển thành các dấu ấn sinh học chẩn đoán UTG không xâm lấn trong tương lai, với độ chính xác cao và tiết kiệm chi phí so với các dấu ấn sinh học quy ước.
We analyzed comprehensive microRNA expression profiles from 1100 serum samples using two microarray datasets with a standardized platform. A miRNAs diagnostic model was developed from LC, qRT-PCR results and other cancer serum samples (Stomach cancer, Biliary tract cancer, Benign pancreatic/biliary tract diseases, Colon cancer, Esophagus cancer, Pancreatic cancer) met the criteria for analysis. R v.4.1.1 and linear model with datasets analysis (Limma) software were used to conduct differential miRNA expression analyses. Finally, the analysis of the area under the curve (AUC) was performed to evaluate the diagnosis capacity of these miRNA biomarkers. 17 upregulated miRNAs such as hsa-miR-141-3p, hsa-miR-1228-5p, hsa-miR-625, hsa-miR-1249, hsa-miR-1913, hsa-miR-3675, hsa-miR-4731, hsa-miR-4783, hsa-miR-6510, hsa-miR-6515, hsa-miR-6766, hsa-miR-6795, hsa-miR-6796, hsa-miR-6798, hsa-miR-6800, hsa-miR-6859, hsa-miR-6870, and 4 downregulated miRNAs such as hsa-miR-199a-5p, hsa-miR-192-5p, hsa-miR-323a, hsa-miR-4706. 21 miRNAs were significantly differentially expressed in LC compared with normal controls. Our findings suggest that serum miRNAs have the potential to be developed into non-invasive diagnostic biomarkers for LC in the future with high accuracy and cost-effectiveness compared with conventional biomarkers.
- Đăng nhập để gửi ý kiến